すいません、自己解決しました。
trainNetworkの中身をみていたところ、入力された教師データのラベルの型と、既に学習されたCNNの最終層のクラスラベルの型をチェックし、お互いの順序あり/なしが不一致ではないか、チェックしているコードを発見しました。 そのため、
DY=categorical(DY,'Ordinal',false)
とし、ラベルデータを順序なしのカテゴリカル型にしたところ、2018aのtrainNetworkで、2017bで作成したCNNを学習させることができました。
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